RDKit是一个用于化学信息学和机器学习的开源软件集合，提供C++和Python的分子计算工具
PyBaMM是一个基于Python的快速灵活物理电池模型库，用于电池性能仿真和老化分析，加速电池设计和创新。
ArviZ是一个用于贝叶斯模型探索性分析的Python包，提供后验分析、数据存储、样本诊断、模型检查和比较等功能。
emcee是一个MIT许可的纯Python实现的Affine Invariant Markov chain Monte Carlo (MCMC) Ensemble采样器，用于贝叶斯推断和概率建模。
SymPy是一个用于符号数学的Python库，旨在成为一个功能齐全的计算机代数系统，同时保持代码简单易懂且易于扩展。
CVXPY是一个开源的Python嵌入式建模语言，用于解决凸优化问题，让用户能够以数学自然的方式表达问题。
一个社区驱动的Python生物信息学库，提供多功能数据结构、算法和教育资源，专为生物数据分析而设计。
PyEnsembl是一个Python接口，用于访问Ensembl参考基因组特征，如基因、转录本和外显子等生物信息学数据。
一个用于分析和可视化（系统发育）树的Python框架，提供树结构操作、程序化可视化和系统发育分析工具。
PyStan是Stan的Python接口，用于贝叶斯推断和统计建模的高性能计算平台
PyMC是一个用于贝叶斯建模的Python概率编程库，支持马尔可夫链蒙特卡洛方法进行统计推断
Astropy是一个用于天文学的Python核心包开发项目，旨在构建可互操作的天文学软件生态系统
SunPy是一个社区开发的、免费开源的Python太阳数据分析环境，专门用于太阳物理学研究。
SpacePy是一个面向空间科学的Python软件包，旨在简化数据分析和可视化，构建在NumPy和Matplotlib之上。
PsychoPy是一个开源的心理学实验软件，用于创建和运行神经科学、心理学和认知科学的实验。
Biopython是一套用于生物计算的Python工具集，由国际开发者团队编写，为生物信息学提供开源库和应用程序。
NetworkX是一个用于创建、操作和研究复杂网络结构的Python软件包，专门处理图论、网络分析和数据科学任务。
graph-tool是一个高效的Python模块，用于图的操纵和统计分析，核心算法用C++实现，性能接近纯C/C++库
Python接口的igraph库，一个快速开源的C语言库，用于操作和分析图（网络）结构数据
PyGSP是一个用于图信号处理的Python包，提供图傅里叶基、信号滤波、插值等操作，支持大规模图分析。